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中外合作揭示LncRNAINHEG調控膠質瘤干細胞的分子機制

文章出處:癌癥藥物網 人氣:-發表時間:2024-03-09 16:52:00

  研究背景


  膠質母細胞瘤(Glioblastoma,GBM) 是最常見和惡性的原發性腦腫瘤,中位生存期小于15個月,惡性程度高。膠質瘤中重要的細胞,膠質瘤干細胞(GSCs),是一類可以自我更新、分化、維持腫瘤異質性、與腫瘤生長和治療耐藥性緊密相關的細胞。闡明GSCs調控的分子機制將擴大我們對疾病的認識,并為靶向GBMs的有效治療策略提供參考。

癌癥

  RNA修飾是控制轉錄調控的基本機制。核糖2'-O-Me甲基化是人類rRNA中豐富的修飾,有100多個位點被標記。人rRNA 2'-O-Me由C/D box小核仁核糖核蛋白snoRNPs)復合物(介導,該蛋白復合物由C/D box snoRNA、甲基轉移酶原纖維蛋白(FBL)和RNA結合蛋白NOP58(NOP58核糖核蛋白)、NOP56和NHP2L19組成。rRNA修飾在核糖體的生物發生和致癌蛋白的翻譯調節中發揮重要作用,以調節多種細胞功能,包括腫瘤發生過程中的細胞增殖、生存和轉化。然而,關于rRNA 2'-O-Me在癌癥干細胞,特別是GSCs中的作用,大家知之甚少。


  文獻來源


  2023年11月,中國科學院/中國科學院大學/北京神經外科研究所/首都醫科大學/西湖大學/西湖實驗室與美國匹茲堡大學醫學中心研究團隊通過Nature Communications期刊在線發表了題為“LncRNA INHEG promotes glioma stem cell maintenance and tumorigenicity through regulating rRNA 2’-O-methylation”的研究論文 ,發現了一種GSC特異性的lncRNA INHEG,它與NOP58相互作用,促進NOP58 類泛素化修飾和下游rRNA 2'-o-甲基化。這一過程支持GSC自我更新和腫瘤發生,提供了對癌癥干細胞中rRNA甲基化的進一步了解,并為致命癌癥提供了潛在的治療靶點。


  研究結果


  rRNA 2'-o-甲基化參與GSCs的自我更新并發揮重要功能


  為了研究rRNA甲基化在腫瘤層次中的作用,作者通過RiboMeth-seq技術檢測了人類患者來源的GSCs(3565和MGG4)和匹配的DGCs中rRNA 2'-OMe水平。


  結果顯示,與分化的腫瘤細胞相比,rRNA 2'-O-Me以及C/D box snoRNP蛋白組分(含FBL, NOP56, NOP58和NHP2L1)在GSCs中都更豐富。進一步用CRISPR-Cas9技術敲除了人類患者來源的GSCs中FBL和NOP58蛋白,減少了細胞生長和抑制了球體的形成;轉錄組測序技術差異表達基因分析表明,FBL或者NOP58調控的基因與癌癥增殖、低存活率、神經干細胞和rRNA表達有關。也就是說,rRNA 2'-o-甲基化調控因子有助于GSC的自我更新和生長。


  LncRNA INHEG在GSCs中高表達,并與NOP58相互作用


  由于NOP58被認為是招募box C/D snoRNAs所需的RNA結合蛋白,于是作者使用紫外交聯免疫沉淀和RNA測序(uvRIP-seq)技術找到并鑒定了與NOP58相互作用的一種新的lncRNA—INHEG分子,由2個外顯子組成,長650bp,主要定位于細胞核,在GSCs中高表達。


  隨后,作者探索了INHEG在GSC自新生維持中的細胞功能,沉默INHEG(CRISPRi)會抑制GSC的增殖,減少腫瘤球的形成;INHEG激活(CRISPRa)的GSCs的腫瘤球形成增加,表明INHEG促進GSC的增殖和自我更新。


  INHEG通過調控C/D box snoRNPs組裝和rRNA 2'-o甲基化狀態來調控多個癌基因的蛋白合成


  INHEG與NOP58相互作用的觀察表明,INHEG可能調控snoRNP的組裝和功能。


  為了探討INHEG在C/D box snoRNP生物發生中的作用,在INHEG下調和上調的膠質瘤細胞中進行NOP58免疫沉淀,INHEG的轉錄抑制減弱了NOP58和NH2PL1之間的聯系,過表達INHEG加強了NOP58與NH2PL1和snoRNA相互作用的效率,從而促進了C/D box snoRNPs的形成。此外,過表達INHEG導致rRNAs 2'-O-methylation水平升高,沉默反之。


  利用RNA-seq和核糖體分析(Ribo-seq)技術進一步評估了INHEG對蛋白質合成的影響。其中,INHEG過表達后提高了1000多個基因的翻譯效率,這些基因主要參與了腫瘤發生和干細胞特性。后續驗證中,檢測到INHEG激活增強了癌基因IGF1R、EGFR、CDK6和PDGFRB的蛋白表達,提示INHEG可能促進膠質瘤發生過程中癌基因的翻譯過程。


  INHEG相關蛋白TAF15與NOP58相互作用,并作為NOP58的SUMO2 E3連接酶


  作者進一步構建了生物素標記探針,并通過RNA pull-down、質譜(MS)聯合證實了INHEG與3個蛋白(TAF15、NOP56和NOP58)之間的相互作用。在這三者關系當中,lncRNA INHEG通過結合NOP58和TAF15(作為SUMO2 E3連接酶)增強了TAF15-NOP58的相互作用,導致了NOP58的類泛素化。


  rRNA 2' -O-Me調控因子促進神經膠質瘤的發生


  為了探索rRNA 2'-o-me調節因子對體內腫瘤生長的作用,通過FBL或NOP58敲除GSCs建立原位異種移植小鼠模型。與對照組相比,FBL或NOP58敲除的GSCs存活時間更長,腫瘤大小更小。與此同時,INHEG缺失的GSCs小鼠的生存時間更長,腫瘤質量減少。INHEG激活顯示出更短的生存期,且腫瘤腫塊更大。


  綜上所述,本研究表明rRNA 2'-O-Me在GSCs的自我更新維持中是一個重要的事件。lncRNA INHEG不僅與NOP58相互作用,而且在GSCs中也高表達。INHEG通過增強TAF15與NOP58相互作用,以及C/D box RNP組裝、rRNA甲基化和蛋白質的重新合成,進而促進GSCs下游的自我更新,從而促進NOP58 sumoylation。這一軸可能為膠質母細胞瘤的治療提供了策略。


  文章摘自網絡,侵刪


此文關鍵字:中外合作揭示LncRNAINHEG調控膠質瘤干細胞的分子機制,LncRNAINHEG,膠質瘤
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